※沖縄本島を除く
| 高校名 | 島 | 出場回数 | 年度 | 成績 |
|---|---|---|---|---|
| 洲本高校 | 淡路島（兵庫） | 4回 | 1953春 1975夏 1986春 2012春（21世紀枠） | 優勝（4勝） 初戦敗退 初戦敗退 初戦敗退 |
| 久賀高校 | 周防大島（山口） | 2回 | 1962春 1999夏 | 初戦敗退 初戦敗退 |
| 隠岐高校 | 隠岐島（島根） | 1回 | 2003春（21世紀枠） | 初戦敗退 |
| 八重山商工 | 石垣島（沖縄県） | 2回 | 2006春 2006夏 | 2回戦進出（1勝） 3回戦進出（2勝） |
| 佐渡高校 | 佐渡島（新潟県） | 1回 | 2011春（21世紀枠） | 初戦敗退 |
| 大島高校 | 奄美大島（鹿児島県） | 2回 | 2014春（21世紀枠） 2022春 | 初戦敗退 初戦敗退 |
| 小豆島高校 | 小豆島（香川県） | 1回 | 2016春（21世紀枠） | 初戦敗退 |
| 大崎高校 | 大島（長崎県） | 1回 | 2021春 | 初戦敗退 |
| 壱岐高校 | 壱岐島（長崎県） | 1回 | 2025春（21世紀枠） | 初戦敗退 |